传统森田疗法的实施主要采取门诊治疗和住院治疗两种形式。鉴于大学咨询的特殊情况，我们将重点介绍森田正马的得意弟子高良武久关于森田疗法过程和步骤的论述，而只对传统的门诊治疗、住院治疗作简单介绍。
住院治疗是一种综合性治疗，通过改变患者的环境，帮助患者摆脱惰性，领悟到烦闷即解脱的道理。住院患者集体生活，通过交流治疗体验，不仅可以改善人际关系，而且有助于能量的外向化。大家同病相怜，从而抛弃以前固有的症状“唯我独有”的个人观，而形成一种“世人如此”的宇宙观。
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森田疗法住院治疗的具体操作和实施 住院治疗一般分为四个阶段：绝对卧床期、轻工作期、重工作期和生活训练期。分别阐述如下：（1）绝对卧床期 让患者在一安静的房间内卧床，禁止会客、读书、谈话、抽烟、听广播等，除吃饭、洗漱和大小便外，保证绝对卧床。要求患者听任强迫观念出现，可以尽可能地去想自己的一切，但患者必须忍受一切痛苦，不能采取任何措施。当患者痛苦到极点时，在极短暂的时间内会迅速消失，即为森田的所谓“烦闷即解脱”的含义。此种体验可以让患者领悟到人的情感有其自己活动的规律，意志无法加以操控。继续的卧床会使患者感到无聊，想起床做任何事情。遂可进入第二期。一般3－7天；（2） 轻工作期让患者从事室内和室外的轻体力劳动，仍不允许患者过多地与别人交谈，禁止看书报、抽烟等活动。夜间卧床7－8小时，每天户外散步2－3小时，晚上记日记。要求患者尽量抑制强迫行为，带着强迫观念坚持工作，让患者逐步恢复体力，通过工作的完成使其认识到坚持行动与症状减弱的关系，从而接受症状使之自然淡化。由于患者解除了对症状的关注，对劳动越来越感兴趣，渴望得到较多较重的工作，遂可转入第三期。此期一般3－7天；（3） 重工作期 主要在园艺治疗区从事重体力劳动，包括挖地、除草、栽树、清理环境卫生等，并继续做上一期的工作。每天早晨、傍晚进行强体力锻炼。晚间可看一些一般性读物，后期可阅读有关森田疗法理论的读物。让患者学会对症状置之不理，以积极有益的活动代替强迫行为。要求患者每晚记日记。通过努力工作，使患者体验完成工作后的喜悦，培养忍耐力，进一步将精神活动能量转向外部世界。此期为3－7天；（4 ）生活训练期可外出、回家、回单位、参加集会和文娱活动，指导患者回归原来的社会环境，恢复原来的社会角色，为患者出院作准备。无论参加何种活动，都要求每晚仍回病房，每天坚持写日记。使患者在真实的社会情境中进一步体验顺应自然的原理，为回归社会做好准备。此期为1至2周。以上是对一般治疗情况的描述，针对每个患者，还要根据实际情况作好治疗计划。治疗过程中要防止过多的说教，关键在于帮助患者在顺应自然的态度下积极行动。
门诊治疗最初只是为个别没有条件做住院治疗的患者所设立，后来，因门诊治疗是把那些症状比较轻而且尚能适应社会生活的人作为治疗对象，所以近年来，门诊疗法不论是在日本还是中国，所起的作用都在扩大。
门诊治疗主要是按照森田疗法的治疗原则，通过个体咨询的形式进行的，一般一周1－2次，每次50分钟左右。通过一般的咨询技术与患者建立良好的咨访关系，在此基础上，全面了解患者的情况，让患者了解客观事物是不以人的意志为转移的，我们的情感活动有其自身的活动规律，我们无法用意志对其加以控制。但是我们的意志可以调控行动，通过积极行动可以陶冶神经质性格，转移对症状的关注，从而达到减轻乃至消除症状的目的。治疗的关键是帮助患者理解顺应自然的道理，接受自己的情感波动，接受症状本身及其带来的痛苦，打破精神交互作用，“忍受痛苦，为所当为”。
森田正马的得意弟子高良武久对森田疗法作了创造性的发挥与补充。他所总结的森田疗法的治疗过程与理念对大学心理咨询是很有启发意义的。具体观点概括如下：
l 让治疗者解释你的处境的心理机能上的本性。确保你能理解为什么如此感受着你的感受。
l 彻底让你的症状如其所是的存在。你必须接受，你的症状已经完全和你本人合为一体了。
l 把你自己绝对地，毫无保留地投入工作。
l 绝对地不要抱怨任何东西。永远不要提起你的症状，也不要把注意力转向它们。
l 期望征服那种“逃进病症中”的诱惑并为征服作好准备。在一开始你的症状也许会有些加重，但你得把这种发展看成是无意义的而予以忽视。
l 为了找出那些反常行为的源头，开始检查你自身。你是在何时第一次学会以这种无益的自私的方式来思考的？你这些无礼举动的原型是什么？
l 试着尝试做没有把握的事情。
l “去带着苦恼生活吧”必须成为你的座右铭。你必须把不安当作你的居所。
l 调整你的外部形象，以便你不以一个神经质的病人的形象出现在世界上。带着个好的表情；严肃认真果断地投入你目前的工作。
l 承认并依赖你的体内平衡。你的恢复将是自然的，如果你恢复了你自然地思考和行为的能力。
